More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2937 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2937  threonine dehydratase  100 
 
 		 418 aa  815    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3767  threonine dehydratase  81.88 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.826311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  46.53 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  46.21 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  45.22 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  46.45 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.94 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.49 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  46.19 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  40.26 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  40.3 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.96 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38.21 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 402 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.43 
 
 		 403 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.17 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.41 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  37.97 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  41.35 
 
 		 412 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40.36 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  45.06 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  38.32 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  45.1 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  43.87 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  38.18 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.49 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.53 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.52 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.03 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.07 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.6 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  35.28 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  43.25 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  40.26 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  38.73 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  45.09 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  45.09 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  42.99 
 
 		 329 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  48.02 
 
 		 358 aa  242  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.09 
 
 		 415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 403 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.27 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  37.28 
 
 		 537 aa  239  9e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.37 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  42.31 
 
 		 501 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  41.12 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  45.97 
 
 		 442 aa  236  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.67 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  41 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  40.07 
 
 		 511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0305  serine/threonine dehydratase  43.35 
 
 		 322 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  36.74 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  40.73 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  42.58 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  45.93 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  39.49 
 
 		 514 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  42.6 
 
 		 405 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  41.78 
 
 		 509 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 509 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  40.97 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.67 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.9 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  42.39 
 
 		 405 aa  227  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>