More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0041 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
246 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  70.28 
 
 
249 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  58.94 
 
 
278 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  58.37 
 
 
239 aa  267  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  54.04 
 
 
238 aa  259  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  53.42 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 
247 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.87 
 
 
233 aa  99  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.2 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  35.14 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  32.77 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.33 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  32.21 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.36 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 
235 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  30.99 
 
 
244 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  30.99 
 
 
244 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  39.33 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  30.3 
 
 
521 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  30.23 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  31.39 
 
 
244 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  35.03 
 
 
250 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  31.77 
 
 
241 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  31.09 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  28.46 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  33.72 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  30.37 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  33.72 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  30.94 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  34.64 
 
 
539 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.12 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  34.03 
 
 
522 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1854  GMP synthase  33.73 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  31.11 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.16 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  32.64 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1891  GMP synthase  34.64 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.888833  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6088  GMP synthase  34.64 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  34.64 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2022  GMP synthase  34.64 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  34.64 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  32.42 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.73 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  31.07 
 
 
599 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  28.65 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5299  GMP synthase  33.33 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  32.34 
 
 
526 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1372  GMP synthase  31.11 
 
 
539 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588127  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.5 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  31.98 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  31.21 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  35 
 
 
532 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  29.84 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  33.33 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  25.52 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  31.21 
 
 
517 aa  79  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  37.24 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  27.57 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  32.47 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.97 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1308  GMP synthase  33.99 
 
 
539 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00743911  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.06 
 
 
517 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  27.78 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  30.51 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  33.56 
 
 
513 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  31.65 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  34.05 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  29.89 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1463  GMP synthase  32.03 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160024  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  39.06 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  35.61 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  33.14 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  27.09 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  33.12 
 
 
520 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  32.67 
 
 
511 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  42 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  32.14 
 
 
525 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  34.23 
 
 
541 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  32.14 
 
 
525 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  33.81 
 
 
512 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  34.92 
 
 
528 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  36.72 
 
 
513 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  29.38 
 
 
513 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  29.38 
 
 
513 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>