More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6554 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6554  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150841  normal  0.274829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  51.35 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3421  maleylacetoacetate isomerase  51.35 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  51.79 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3502  maleylacetoacetate isomerase  50.9 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  48 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  44.64 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  44.2 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  44 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  43.3 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  42.48 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  43.81 
 
 		 214 aa  178  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  41.96 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  45.98 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  41.44 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  40.89 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  41.85 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  43.3 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  42.22 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  43.42 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  41.52 
 
 		 213 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  42.04 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  42.04 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  43.81 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  41.44 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  42.48 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  43.36 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  41.15 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  40.62 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  43.61 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  40.54 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  43.17 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  40.99 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  39.74 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  39.74 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  38.39 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  45.09 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  41.45 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  42.22 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  44.24 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  41.53 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  42.66 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  41.53 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  43.17 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  40.35 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  40.17 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  40.27 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  40.27 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  40.27 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  38.77 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  39.47 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  40.27 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  41.67 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  39.38 
 
 		 220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  37.28 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  41.96 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  39.82 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  40.71 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  39.38 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  43.19 
 
 		 200 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  39.91 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  42.04 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  35.81 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  40.27 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  43.36 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  39.41 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  41.78 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  39.21 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  42.04 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  42.22 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  42.04 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  40.97 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  41.96 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  42.34 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  40.36 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  38.39 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  38.39 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  38.39 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  38.39 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  39.62 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  40.59 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  40.1 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  39.62 
 
 		 214 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>