More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4349 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4349  putative cytochrome P450  100 
 
 
414 aa  845    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3367  cytochrome P450-like protein  51.59 
 
 
392 aa  356  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0143  cytochrome P450  47.03 
 
 
407 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  40.86 
 
 
416 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1965  cytochrome P450  42.97 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  28.24 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.27 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  31.13 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.45 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  27.89 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  27.94 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  28.8 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  27.94 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  25.99 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  28.29 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  27.88 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  28.57 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  28.77 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  29.19 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  27.27 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.88 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  28.53 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  27.88 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  28.03 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  29.32 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  27.14 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  25.97 
 
 
388 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  25.34 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  26.69 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  26.67 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  29.21 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  28.61 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  27.3 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  26.84 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  26.84 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  26.76 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  23.51 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  25.81 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  26.95 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  28 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  26.57 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  29.14 
 
 
1046 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  28.22 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  24.37 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  26.2 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  24.37 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  26.96 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  24 
 
 
938 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  25.89 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  27.32 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  25.89 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  25.89 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  26.2 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  24.09 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  27.1 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  27.86 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  27.41 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  26.51 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  27.37 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  32.36 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  26.67 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  32.36 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  28.16 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  25.99 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  25.97 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  25.99 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  25.97 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  25.65 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  25.97 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  25.99 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  34.02 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  27.78 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  26.84 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  25.97 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  25.67 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  22.86 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  27.03 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  25.44 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  25.77 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  22.93 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  26.18 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  26.39 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  28.71 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  33.33 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  26.54 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  24.3 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  25.83 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  28.38 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  26.59 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  25.63 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  23.14 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  25.28 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  26.99 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  27.62 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  24.26 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  23.86 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  27.24 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  26.7 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  24.93 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2018  Acyl transferase  37.58 
 
 
738 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>