30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3850 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  38.17 
 
 
386 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  36.94 
 
 
366 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  36.98 
 
 
366 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  37.27 
 
 
366 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  26.55 
 
 
884 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  30.42 
 
 
345 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  29.05 
 
 
911 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  28.12 
 
 
882 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  26.55 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  28.75 
 
 
911 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  29.05 
 
 
911 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  28.96 
 
 
883 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  28.4 
 
 
907 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  30 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  27.47 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  26.71 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  28.45 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  26.69 
 
 
880 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  27 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  28.53 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  28.53 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  25.37 
 
 
394 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  25.82 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  26.97 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  27.16 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  26.49 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  25.73 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  24.51 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.16 
 
 
2172 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>