42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1449 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  100 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  31.25 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.61 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  38.32 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  36.26 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  38.79 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  36.84 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  39.72 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  33.53 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  30.92 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  29.25 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  35.2 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  37.41 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  32.47 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  28.3 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  33.33 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  36.11 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  33.71 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  35.11 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  29.79 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  35.82 
 
 		 597 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  33.71 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  33.71 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  34.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  34.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  35.82 
 
 		 597 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  29.19 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  34.72 
 
 		 246 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  35.48 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  36.06 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  30.99 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  33.52 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  31.64 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  31.58 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  33.16 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  32.8 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  31.45 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  32.22 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  31.47 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  31.37 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>