171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1241 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  100 
 
 
338 aa  689    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  42.42 
 
 
326 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  42.6 
 
 
335 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  40.12 
 
 
327 aa  215  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  40.43 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  44.38 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  37.68 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  36.49 
 
 
342 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  38.79 
 
 
341 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  35.33 
 
 
349 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  35.33 
 
 
349 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  38.1 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  38.74 
 
 
326 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  37.13 
 
 
345 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  39.22 
 
 
334 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  34.27 
 
 
353 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  35.06 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  37.11 
 
 
361 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  33.73 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  33.23 
 
 
332 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  33.54 
 
 
322 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  35.17 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  34.36 
 
 
323 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  34.36 
 
 
323 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  34.36 
 
 
323 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  32.63 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  33.24 
 
 
344 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  30.23 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  30.61 
 
 
330 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  33.44 
 
 
321 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  33.43 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  28.65 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  33.74 
 
 
321 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  33.44 
 
 
321 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  31.9 
 
 
320 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  32.63 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  32.14 
 
 
339 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  34.34 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  31.96 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  33.13 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  33.13 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  33.13 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  33.13 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  29.05 
 
 
318 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  27.03 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  27.41 
 
 
345 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  32.52 
 
 
321 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  32.24 
 
 
335 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  27.49 
 
 
345 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  30.03 
 
 
346 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  29.18 
 
 
320 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  31.66 
 
 
332 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  29.09 
 
 
340 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  26.45 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  30.54 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  34.26 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  28.19 
 
 
367 aa  116  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  30.3 
 
 
315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  29.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  32.23 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  29.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  32.23 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1766  glucokinase  32.13 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  30.12 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  30.37 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  30.15 
 
 
337 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  32.65 
 
 
317 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  31.67 
 
 
357 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  30.61 
 
 
322 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  30.45 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  29.79 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  29.7 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  28.53 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  30.7 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48774  glucokinase  27.4 
 
 
436 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.985035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  30.37 
 
 
319 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  30.45 
 
 
333 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  30.45 
 
 
333 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  29.29 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  28.18 
 
 
346 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  29.88 
 
 
332 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
616 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  28.7 
 
 
339 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  29.36 
 
 
335 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  30.67 
 
 
339 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  29.04 
 
 
341 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  31.21 
 
 
325 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  29.7 
 
 
323 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  28.17 
 
 
317 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  30.75 
 
 
318 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  29.05 
 
 
335 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  31.97 
 
 
313 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>