28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0884 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
125 aa  254  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  43.8 
 
 
123 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  45.13 
 
 
123 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  41.18 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  48.91 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  38.71 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  37.08 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  37.08 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  34.09 
 
 
217 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  37.65 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  41.25 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  30.36 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2322  hypothetical protein  54.76 
 
 
46 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.367977  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  35.48 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  31.06 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  31.86 
 
 
141 aa  47.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  34.83 
 
 
450 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  36.19 
 
 
144 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  34.07 
 
 
127 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  35.63 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  35.24 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  30.89 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  43.55 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  56.25 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  31.18 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  34.88 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  31.91 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  38.16 
 
 
131 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>