230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0120 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  100 
 
 
513 aa  1059    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  69.7 
 
 
516 aa  707    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  66.67 
 
 
516 aa  687    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  58.86 
 
 
507 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  58.86 
 
 
507 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.64 
 
 
516 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.28 
 
 
516 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.08 
 
 
516 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 
512 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
512 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
512 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.28 
 
 
516 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  51.59 
 
 
510 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 
517 aa  485  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
513 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  49.5 
 
 
512 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
525 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 
512 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.8 
 
 
505 aa  481  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.98 
 
 
511 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
491 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  47.02 
 
 
509 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  49.01 
 
 
513 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  47.63 
 
 
508 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
512 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 
512 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 
532 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 
512 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
516 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.15 
 
 
532 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  46.69 
 
 
511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  49.3 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 
509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  46.81 
 
 
529 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 
533 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 
515 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  46.75 
 
 
511 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
511 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  47.94 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  46.6 
 
 
487 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
542 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.8 
 
 
510 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
487 aa  464  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  46.53 
 
 
511 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  48.6 
 
 
510 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 
532 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  47.34 
 
 
511 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  47.32 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 
532 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  46.24 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  46.86 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  46.42 
 
 
515 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  45.65 
 
 
540 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  47.74 
 
 
516 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
510 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
513 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  45.88 
 
 
511 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 
515 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
524 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
540 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  46.46 
 
 
545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  46.41 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 
517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  47.02 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  46.74 
 
 
523 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
514 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
514 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  45.29 
 
 
514 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  45.16 
 
 
540 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.53 
 
 
515 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
514 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  45.29 
 
 
515 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
514 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  47.53 
 
 
519 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  46.84 
 
 
519 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  44.64 
 
 
514 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.51 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  47.23 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  47.4 
 
 
524 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  46.64 
 
 
519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  44.94 
 
 
518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1776  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
523 aa  445  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.403948  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 
487 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>