More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3344 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  54.4 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  52.8 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0667  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.86 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1245  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.331226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.98 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 112 aa  57  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  40.28 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 309 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.16 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.84 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.84 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  52.63 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  49.23 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.92 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  34.74 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.06 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.06 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>