73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1756 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
268 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2093  hypothetical protein  41.94 
 
 
261 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  42.94 
 
 
283 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  41.27 
 
 
267 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  43.66 
 
 
297 aa  99  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  42.97 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  42.65 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  40.14 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  40.14 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  41.35 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  38.97 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  32.62 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 
483 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  36.19 
 
 
137 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 
472 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  37.93 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  32.48 
 
 
341 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  41.6 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  34.86 
 
 
622 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  33.59 
 
 
452 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  28.74 
 
 
367 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.39 
 
 
363 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  40 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.39 
 
 
363 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.03 
 
 
363 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  40.62 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.57 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  32.35 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  28.12 
 
 
495 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  38.52 
 
 
478 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  37.62 
 
 
308 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  32.31 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  32.31 
 
 
370 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  31.69 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  31.69 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  32.58 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 
367 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  31.54 
 
 
370 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  31.54 
 
 
370 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  33.96 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  36.63 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.54 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
370 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  28.47 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 
301 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  30.5 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  31.54 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.54 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  30.5 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  30.5 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  30.5 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  33 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  28.47 
 
 
482 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  31.4 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
370 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
370 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  31.54 
 
 
369 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  25.9 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  32.35 
 
 
319 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>