28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0407 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  892    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  31.65 
 
 
434 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  28.95 
 
 
545 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  31.45 
 
 
486 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  29.3 
 
 
450 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  25.38 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  25.69 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  30.05 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  27.51 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  27.51 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  27.51 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  25.38 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  25.38 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  27.51 
 
 
374 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  25.68 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  27.51 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  26.98 
 
 
377 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  24.38 
 
 
454 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  23.5 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  24.88 
 
 
514 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  24.19 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  21.16 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  22.26 
 
 
483 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  36.71 
 
 
1293 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.99 
 
 
1022 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  25.52 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  23.41 
 
 
474 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  23.62 
 
 
477 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>