More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1863 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.5 
 
 		 537 aa  738    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 534 aa  1078    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.18 
 
 		 540 aa  768    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.86 
 
 		 542 aa  746    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  67.9 
 
 		 570 aa  723    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 432 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  33.87 
 
 		 422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  51.1 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  49.56 
 
 		 417 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 361 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 358 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 358 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 357 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 370 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 407 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 374 aa  110  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 386 aa  100  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  28.81 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  27.31 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  35.57 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2580  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.804405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 347 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  24.05 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  31.76 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 349 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  28.92 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  23.05 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 341 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 400 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06710  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 362 aa  57  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 400 aa  57  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 400 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 329 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 327 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 327 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>