More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1286 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1286  ISXoo15 transposase  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  99.38 
 
 		 343 aa  330  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  62.73 
 
 		 315 aa  208  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  55.41 
 
 		 326 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  55.41 
 
 		 326 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  55.41 
 
 		 326 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  55.41 
 
 		 326 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  56.76 
 
 		 336 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  50.93 
 
 		 339 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  50.93 
 
 		 339 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  50.93 
 
 		 339 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  51.55 
 
 		 340 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  56.38 
 
 		 342 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 342 aa  147  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  55.7 
 
 		 342 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  52.41 
 
 		 339 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02175  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  67.62 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  49.32 
 
 		 356 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  49.32 
 
 		 356 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  48.34 
 
 		 343 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  45.12 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  48.05 
 
 		 423 aa  124  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  48.05 
 
 		 423 aa  124  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  40.59 
 
 		 326 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  48.05 
 
 		 423 aa  124  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  48.05 
 
 		 423 aa  124  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  48.05 
 
 		 423 aa  124  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 519 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 519 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 519 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 519 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 519 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 496 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 525 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  39.62 
 
 		 385 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  39.62 
 
 		 385 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  39.62 
 
 		 385 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  42.14 
 
 		 380 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  42.14 
 
 		 380 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02141  hypothetical protein  57.27 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  43.37 
 
 		 402 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  43.62 
 
 		 385 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  43.62 
 
 		 385 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 370 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  36.96 
 
 		 409 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  50.43 
 
 		 300 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 334 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 334 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 481 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 		 386 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  42.41 
 
 		 421 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  43.33 
 
 		 386 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  43.33 
 
 		 386 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 386 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  41.72 
 
 		 386 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  43.05 
 
 		 399 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  43.05 
 
 		 399 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  40.46 
 
 		 466 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 401 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  39.07 
 
 		 386 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  42.48 
 
 		 401 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  40 
 
 		 400 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 		 386 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 465 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  41.81 
 
 		 465 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 465 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 465 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>