More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02175 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02175  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  100 
 
 
133 aa  277  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  96.24 
 
 
315 aa  275  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  66.42 
 
 
343 aa  186  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  61.47 
 
 
336 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1286  ISXoo15 transposase  67.62 
 
 
183 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  49.23 
 
 
339 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01165  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  81.08 
 
 
127 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  79.45 
 
 
144 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  45.38 
 
 
342 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  78.38 
 
 
144 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 
342 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  46.92 
 
 
356 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  46.92 
 
 
356 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  47.69 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  42.64 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  42.86 
 
 
343 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  47.69 
 
 
326 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  47.69 
 
 
326 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  47.69 
 
 
326 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  47.69 
 
 
326 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02142  remnant of a transposase gene protein  69.05 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.965684  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  44.76 
 
 
423 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  44.76 
 
 
423 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  44.76 
 
 
423 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  44.76 
 
 
423 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  44.76 
 
 
423 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
399 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
399 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  39.82 
 
 
386 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  38.14 
 
 
385 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  38.14 
 
 
385 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  40.65 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
380 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
380 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  38.14 
 
 
385 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  41.98 
 
 
401 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  44.76 
 
 
317 aa  98.6  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 
370 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 
342 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  45.71 
 
 
401 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 
386 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  40.46 
 
 
385 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  38.64 
 
 
326 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  45.71 
 
 
189 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  39.69 
 
 
385 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  42.19 
 
 
466 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  40.5 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 
386 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  44.23 
 
 
386 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
496 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  39.09 
 
 
386 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
519 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
519 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
525 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
519 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
519 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
519 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  38.18 
 
 
386 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  40 
 
 
400 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 
386 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 
386 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  38.14 
 
 
421 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  43.4 
 
 
409 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  39.5 
 
 
334 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  39.5 
 
 
334 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  39.5 
 
 
334 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  39.45 
 
 
243 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  35.94 
 
 
465 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  39.09 
 
 
386 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>