162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02141 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02141  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  307  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  59.81 
 
 		 315 aa  126  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  57.27 
 
 		 343 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1286  ISXoo15 transposase  57.27 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  42.45 
 
 		 339 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  42.06 
 
 		 343 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  44.35 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  42.45 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  42.45 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  42.45 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02175  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  55.26 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06215  transposase  74.42 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.893102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00951  transposase  74.42 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02568  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04083  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.951935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03800  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03015  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01166  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01835  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.403808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01212  transposase  74.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06100  transposase  74.42 
 
 		 43 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00936  transposase  74.42 
 
 		 43 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.986379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  38.74 
 
 		 409 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  42.99 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  42.06 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  39.32 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  39.32 
 
 		 402 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  40.54 
 
 		 326 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  42.86 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  42.86 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  42.86 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  42.86 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  42.86 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  39.52 
 
 		 356 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  39.52 
 
 		 356 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  36.54 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  36.54 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 481 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 496 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 525 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  35.19 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  37.5 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  33.64 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  46.34 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  41.28 
 
 		 457 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  35.65 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  35.65 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  37.61 
 
 		 466 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  32.71 
 
 		 385 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>