140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01212 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06215  transposase  98.44 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.893102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00951  transposase  98.44 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04083  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.951935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03800  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01166  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01212  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01835  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.403808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02568  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03015  transposase  100 
 
 		 64 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  81.25 
 
 		 315 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  64.52 
 
 		 343 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1286  ISXoo15 transposase  64.52 
 
 		 183 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06100  transposase  100 
 
 		 43 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00936  transposase  100 
 
 		 43 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.986379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01855  transposase  95 
 
 		 41 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04614  transposase  100 
 
 		 41 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  59.26 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  59.26 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  59.26 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  59.26 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  60 
 
 		 343 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02141  hypothetical protein  74.42 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03316  transposase  96.97 
 
 		 73 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  51.67 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  61.11 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  49.18 
 
 		 409 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  54.72 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  60 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  60 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  56.36 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  56.36 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  44.83 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  51.85 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  51.85 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 496 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  50.91 
 
 		 525 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  50 
 
 		 466 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 479 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 479 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 479 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  48.15 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  48.15 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  55.32 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  55.32 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  50.98 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  58.33 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  58.33 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 474 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 474 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 474 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  51.85 
 
 		 385 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  51.85 
 
 		 385 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  46.3 
 
 		 453 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  45.16 
 
 		 465 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  48.15 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  48.15 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  48.15 
 
 		 466 aa  57  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  48.15 
 
 		 466 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  48.15 
 
 		 466 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  48.15 
 
 		 466 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  48.15 
 
 		 466 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  48.15 
 
 		 466 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>