46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3355 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
423 aa  840    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
478 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 
488 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
440 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 
440 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  22.52 
 
 
478 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
484 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
478 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
484 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  22.58 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 
449 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.98 
 
 
476 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  31.87 
 
 
470 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 
482 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 
504 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  34.07 
 
 
471 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
444 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
424 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 
499 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  30.77 
 
 
483 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  23.26 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  19.57 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
463 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  36.26 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  21.87 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  31.46 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  32.56 
 
 
517 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 
482 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>