77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1713 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 475 aa  964    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  57.51 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.08 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.08 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.27 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.69 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.28 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  55 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.64 
 
 		 485 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.64 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  46.44 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.4 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  25.81 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.48 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.35 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.85 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.53 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.1 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  23.13 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.76 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.16 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.34 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.93 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.88 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.59 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.26 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.64 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.12 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.68 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.37 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.89 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.3 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.81 
 
 		 380 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.06 
 
 		 314 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  24.3 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.14 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  24 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  22.29 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  23.24 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.14 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.69 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.24 
 
 		 396 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.54 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.24 
 
 		 396 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.24 
 
 		 396 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.24 
 
 		 396 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.24 
 
 		 396 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.24 
 
 		 396 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.97 
 
 		 363 aa  50.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.46 
 
 		 361 aa  50.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  26.6 
 
 		 366 aa  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.21 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.91 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.33 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.99 
 
 		 396 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.43 
 
 		 342 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.32 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.18 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  30.09 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.22 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.34 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.63 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.22 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  30.66 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.83 
 
 		 316 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.1 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.29 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.72 
 
 		 342 aa  44.3  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.68 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.17 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  61.54 
 
 		 316 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2913  2-nitropropane dioxygenase, NPD  21.43 
 
 		 315 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000125004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1293  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.85 
 
 		 361 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000110305  hitchhiker  0.00000426168 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33 
 
 		 345 aa  43.1  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>