More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1161 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
426 aa  860    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  25.58 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1826  histidine kinase  27.83 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.778764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  25.51 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1865  sensor protein PhoQ  27.98 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  23.68 
 
 
348 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  25.1 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
799 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  26.19 
 
 
485 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  27.06 
 
 
486 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
453 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  25.87 
 
 
487 aa  63.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1100  histidine kinase  29.84 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.4 
 
 
422 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  29.36 
 
 
646 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
695 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  30.23 
 
 
746 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1127  sporulation kinase B  21.19 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.918455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  23.17 
 
 
857 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
953 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4112  sporulation kinase B  21.19 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4025  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4058  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3916  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3748  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3764  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4131  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
495 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4223  sporulation kinase B  23.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2496  histidine kinase  25.12 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0459847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2708  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.85 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3835  histidine kinase  21.19 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
590 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
582 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 
620 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0679  sensory transduction histidine kinase  28.41 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.502245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  24.79 
 
 
541 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  23.67 
 
 
357 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  25.69 
 
 
483 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
480 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  22.76 
 
 
348 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
590 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 
348 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 
348 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 
471 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  28.63 
 
 
561 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  28.1 
 
 
265 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
498 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  26.37 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.77 
 
 
611 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  24.05 
 
 
560 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  26.37 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  25.25 
 
 
484 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  26.37 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  26.37 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  26.37 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.062219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01127  sensory histidine kinase in two-compoent regulatory system with PhoP  26.37 
 
 
486 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01135  hypothetical protein  26.37 
 
 
486 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
784 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  25.25 
 
 
484 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  25.25 
 
 
468 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  24.65 
 
 
392 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1249  sensor protein PhoQ  27.23 
 
 
486 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2474  sensor protein PhoQ  27.23 
 
 
486 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2023  histidine kinase  24.89 
 
 
473 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.618926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
1043 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
836 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
497 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
836 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 
479 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  26.2 
 
 
496 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  23.46 
 
 
903 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
579 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
836 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.78 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  26.7 
 
 
486 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  23.91 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  22.14 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
850 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  26.7 
 
 
486 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  22.33 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  30 
 
 
779 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
839 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
504 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1307  sensor protein PhoQ  26.7 
 
 
486 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1292  sensor protein PhoQ  26.7 
 
 
486 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  26.7 
 
 
486 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
890 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001286  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  26.16 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0339  histidine kinase  20.86 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
895 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>