More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0049 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
348 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  85.22 
 
 
348 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.51 
 
 
348 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.51 
 
 
348 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.92 
 
 
348 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  74.64 
 
 
348 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.79 
 
 
348 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0060  ATPase domain-containing protein  75.5 
 
 
348 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000213269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0054  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.5 
 
 
348 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001286  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  56.43 
 
 
344 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4478  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.69 
 
 
356 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
907 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
891 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  35.56 
 
 
905 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
907 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
894 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
897 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
905 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04384  sensor protein KdpD  37.89 
 
 
886 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
912 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  36.56 
 
 
913 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
884 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
884 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  34.55 
 
 
907 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
896 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  35.71 
 
 
905 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
889 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
884 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  32.13 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  39.23 
 
 
885 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  37.87 
 
 
885 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
887 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
887 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  36.12 
 
 
914 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
897 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  38.76 
 
 
885 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
884 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  35.74 
 
 
902 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
907 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
890 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
902 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  37.74 
 
 
874 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
905 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
887 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
888 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34 
 
 
897 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
892 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
901 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  35.87 
 
 
887 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
883 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
900 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3078  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
886 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3503  histidine kinase  31.42 
 
 
387 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
342 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  32.17 
 
 
910 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
902 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
900 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.77 
 
 
902 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.45 
 
 
895 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.76 
 
 
539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
895 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
902 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1460  ATP-binding region ATPase domain protein  27.46 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.06 
 
 
938 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
502 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
614 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3764  histidine kinase  34.45 
 
 
545 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  34.19 
 
 
937 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1864  ATPase domain-containing protein  30.54 
 
 
371 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
938 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  32.13 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  32.52 
 
 
488 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
894 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
541 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
608 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  31 
 
 
906 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  34.26 
 
 
857 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
951 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
579 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
590 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
609 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.53 
 
 
993 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  34.53 
 
 
993 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  34.53 
 
 
954 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  34.53 
 
 
954 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  34.53 
 
 
993 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  34.84 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
902 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
396 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
619 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.55 
 
 
1035 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.96 
 
 
926 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
639 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
639 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>