More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0925 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
382 aa  765    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.73 
 
 
389 aa  500  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 
386 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 
386 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.59 
 
 
388 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
386 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.69 
 
 
386 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.69 
 
 
386 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.95 
 
 
392 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.74 
 
 
387 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.23 
 
 
391 aa  420  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.19 
 
 
388 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.86 
 
 
390 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.48 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.85 
 
 
388 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.65 
 
 
392 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
388 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3875  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.78 
 
 
392 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.91 
 
 
390 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.17 
 
 
391 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
388 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.17 
 
 
392 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.69 
 
 
384 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.11 
 
 
388 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.65 
 
 
391 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.05 
 
 
389 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  51.04 
 
 
389 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  52.59 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.59 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.74 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.38 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.38 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.74 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.07 
 
 
388 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 
388 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  51.17 
 
 
392 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0894  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117114  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  50.91 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0771  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.52 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.59 
 
 
388 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  51.6 
 
 
389 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.33 
 
 
386 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.02 
 
 
410 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.02 
 
 
400 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.66 
 
 
388 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 
390 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
386 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 
387 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.05 
 
 
392 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.51 
 
 
403 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.17 
 
 
389 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
385 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  50.13 
 
 
390 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.05 
 
 
392 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  50.13 
 
 
390 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.65 
 
 
388 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.65 
 
 
388 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
388 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.53 
 
 
399 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  50.39 
 
 
390 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
388 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  47.93 
 
 
395 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 
390 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
388 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
389 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.48 
 
 
386 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.64 
 
 
407 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.07 
 
 
388 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.06 
 
 
387 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.88 
 
 
388 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.09 
 
 
388 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.09 
 
 
388 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
385 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  51.06 
 
 
387 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  49.09 
 
 
396 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.14 
 
 
388 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.77 
 
 
398 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.89 
 
 
399 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.66 
 
 
387 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.85 
 
 
388 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.09 
 
 
388 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.85 
 
 
388 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>