More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0759 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0759  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0880  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.25 
 
 
200 aa  202  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0750  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.22 
 
 
202 aa  194  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0416101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.83 
 
 
230 aa  189  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  30.63 
 
 
167 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  29.65 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  29.7 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  29.94 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  28.82 
 
 
163 aa  89  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  28.48 
 
 
165 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  30.38 
 
 
169 aa  87.8  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  28.48 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  28.05 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  28.24 
 
 
163 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.33 
 
 
132 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  28.3 
 
 
163 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  30.18 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  30.18 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  31.4 
 
 
162 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  26.67 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  27.44 
 
 
162 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  28.22 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  28.05 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  30.23 
 
 
167 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.67 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  30 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  26.83 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  27.88 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  23.78 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  28.93 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  28.3 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  28.05 
 
 
163 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  25.61 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.53 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.12 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  25.61 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
161 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  28 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28 
 
 
132 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28 
 
 
132 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.27 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  29.59 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  28.99 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.92 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  25.93 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  26.29 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  28.99 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  26.22 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.33 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  27.44 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  27.44 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  27.44 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  27.44 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  26.83 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  25.95 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  25.61 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  26.83 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  24.12 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  24.85 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.52 
 
 
168 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  27.63 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  30.59 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.58 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  28.99 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  24.56 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.49 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.17 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.91 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  24.85 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  26.09 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  24.39 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  24.85 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  26.38 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  26.71 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  26.55 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  26.09 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  26.38 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  30.72 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  26.11 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  30.72 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  27.5 
 
 
162 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  26.09 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  24.38 
 
 
162 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  27.37 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  25 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.95 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  29.24 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.85 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>