More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0627 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 230 aa  476  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0759  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.83 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0880  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.33 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0750  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.9 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0416101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  34.48 
 
 		 165 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  34.78 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.4 
 
 		 169 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  33.71 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  34.08 
 
 		 170 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  32.42 
 
 		 165 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  30.64 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.03 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  31.89 
 
 		 165 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  32.73 
 
 		 169 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  32.4 
 
 		 162 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  27.54 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  32.97 
 
 		 169 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  29.55 
 
 		 163 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  34.16 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  34.16 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  31.84 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  34.16 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  32.93 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  32.16 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  35.4 
 
 		 163 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  28.9 
 
 		 167 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  32.75 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  31.71 
 
 		 164 aa  95.9  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.16 
 
 		 177 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 		 164 aa  95.9  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 		 167 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 		 167 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  34.64 
 
 		 165 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  30.9 
 
 		 163 aa  95.1  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  32.56 
 
 		 162 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  32.16 
 
 		 162 aa  95.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  31.4 
 
 		 169 aa  94.4  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  34.13 
 
 		 170 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  32.72 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  32.1 
 
 		 161 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.54 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 		 164 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  29.48 
 
 		 163 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  33.54 
 
 		 163 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  32.16 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  31.4 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 161 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  32.16 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  32.16 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  31.29 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  30.18 
 
 		 163 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  31.58 
 
 		 162 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  31.58 
 
 		 162 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.24 
 
 		 179 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  31.58 
 
 		 162 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 		 162 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  28.83 
 
 		 162 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 		 162 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  30.25 
 
 		 161 aa  92.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.84 
 
 		 165 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  31.1 
 
 		 164 aa  92  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.76 
 
 		 168 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34 
 
 		 162 aa  91.7  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  29.81 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  28.99 
 
 		 163 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.48 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 273 aa  90.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.21 
 
 		 165 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.05 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  29.17 
 
 		 162 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 		 162 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 		 162 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.87 
 
 		 180 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  28.99 
 
 		 163 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  27.22 
 
 		 162 aa  89.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 		 163 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  31.87 
 
 		 163 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.82 
 
 		 132 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  29.48 
 
 		 175 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  30.82 
 
 		 163 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  28.93 
 
 		 132 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.93 
 
 		 131 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  29.38 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  27.71 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>