More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0750 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0750  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 202 aa  422  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0416101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0880  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  61.69 
 
 		 200 aa  261  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0759  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.22 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.9 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.21 
 
 		 132 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.21 
 
 		 131 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  28.03 
 
 		 163 aa  98.2  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.1 
 
 		 132 aa  97.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  30.32 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 		 132 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 		 132 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.43 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.56 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.76 
 
 		 165 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 		 169 aa  95.5  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 273 aa  95.1  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 		 167 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 		 167 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 		 135 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.56 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  27.75 
 
 		 165 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  30.34 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.67 
 
 		 168 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  32.65 
 
 		 162 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  28.48 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  29.68 
 
 		 169 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  30.25 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  28.39 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  29.14 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  30.32 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  29.03 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  28.39 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  27.81 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 		 163 aa  90.5  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  31.11 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  26.83 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  29.68 
 
 		 163 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.77 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.46 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 		 161 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  26.71 
 
 		 163 aa  88.6  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  29.29 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  27.74 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  29.29 
 
 		 166 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  27.59 
 
 		 163 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.62 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  27.1 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.46 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  29.01 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  26.83 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  27.86 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  27.89 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  27.1 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 		 164 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  27.97 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  27.1 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  27.1 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  29.75 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 		 163 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  30.83 
 
 		 167 aa  86.3  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  29.32 
 
 		 163 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  26.45 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  29.32 
 
 		 163 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  27.61 
 
 		 164 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  28.48 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  26.47 
 
 		 162 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 		 161 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.05 
 
 		 300 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  30.07 
 
 		 164 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  29.08 
 
 		 162 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  34.33 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  27.66 
 
 		 162 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  28.37 
 
 		 162 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  26.67 
 
 		 163 aa  85.1  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  26.63 
 
 		 174 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  26.67 
 
 		 163 aa  85.1  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>