More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0880 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0880  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0750  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  61.69 
 
 
202 aa  261  4e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0416101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0759  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.25 
 
 
208 aa  202  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.33 
 
 
230 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.33 
 
 
179 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.25 
 
 
132 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  33.56 
 
 
163 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.56 
 
 
135 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  32.88 
 
 
132 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.43 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.88 
 
 
131 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  30.56 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
162 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.76 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.51 
 
 
132 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.51 
 
 
132 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  28.03 
 
 
167 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  28.28 
 
 
162 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
168 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
162 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.79 
 
 
162 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.57 
 
 
300 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.13 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.14 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  30.71 
 
 
161 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  28.85 
 
 
163 aa  92.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  28.76 
 
 
162 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.33 
 
 
177 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  29.38 
 
 
163 aa  91.7  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  31.16 
 
 
165 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  31.41 
 
 
196 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  32.41 
 
 
175 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  31.65 
 
 
163 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  29.58 
 
 
163 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  29.66 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  28.97 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.59 
 
 
222 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  28.97 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  28.97 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  30.88 
 
 
163 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  29.22 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  28.99 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.89 
 
 
171 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  29.27 
 
 
162 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  29.27 
 
 
224 aa  88.6  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  28.48 
 
 
226 aa  88.6  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
184 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.25 
 
 
247 aa  88.6  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.77 
 
 
214 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  29.25 
 
 
211 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  31.47 
 
 
164 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  32.19 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  30.43 
 
 
181 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 
164 aa  88.2  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  26.71 
 
 
162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.88 
 
 
254 aa  87.8  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  28.85 
 
 
162 aa  87.8  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  30.92 
 
 
170 aa  87.8  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  28.3 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  28.3 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  28.3 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  28.66 
 
 
161 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
177 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  29.71 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  30.14 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  27.63 
 
 
163 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 
273 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  26.25 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  30.47 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  27.63 
 
 
163 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  28.76 
 
 
164 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  26.88 
 
 
162 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  28.29 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  28.29 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.4 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  28.26 
 
 
171 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  32.24 
 
 
171 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  28.47 
 
 
162 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.66 
 
 
230 aa  85.5  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.58 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
164 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.12 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  26.99 
 
 
163 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>