More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0638 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  59.23 
 
 		 511 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  100 
 
 		 547 aa  1132    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  41.71 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  40.51 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  40.59 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  43.52 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  39.67 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  39.31 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  41.18 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  39.31 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  39.31 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  39.16 
 
 		 503 aa  392  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  38.07 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  40.83 
 
 		 514 aa  389  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  39.19 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  37.32 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  38.77 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  38.21 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  38.43 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  37.74 
 
 		 511 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  37.04 
 
 		 502 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  39.05 
 
 		 502 aa  362  8e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  36.81 
 
 		 508 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  37.52 
 
 		 519 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  39.89 
 
 		 512 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  39.04 
 
 		 509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  36.81 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  37.94 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  39.12 
 
 		 517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  40.29 
 
 		 510 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  37.52 
 
 		 509 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  36.53 
 
 		 509 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  37.62 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  37.7 
 
 		 509 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  36.53 
 
 		 509 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  36.21 
 
 		 509 aa  350  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  35.15 
 
 		 509 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  36.88 
 
 		 509 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  38.8 
 
 		 530 aa  349  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  38.25 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  39.09 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  37.11 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  37.64 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  37.02 
 
 		 509 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  36.85 
 
 		 512 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  38.46 
 
 		 505 aa  345  8e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  36.99 
 
 		 513 aa  345  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  36.23 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  36.8 
 
 		 534 aa  343  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  37.62 
 
 		 513 aa  343  7e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  38.16 
 
 		 518 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  38.64 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  36.99 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  35.91 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  37.05 
 
 		 507 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  38.14 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  37.29 
 
 		 512 aa  340  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  39.38 
 
 		 515 aa  340  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  37.22 
 
 		 510 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  37.96 
 
 		 516 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  37.29 
 
 		 511 aa  339  9e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  35.9 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  37.29 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  38.81 
 
 		 504 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  38.76 
 
 		 512 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  36.63 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  36.06 
 
 		 509 aa  335  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  36.36 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  37.21 
 
 		 512 aa  334  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  36.18 
 
 		 501 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  38.09 
 
 		 505 aa  333  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  36.84 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 510 aa  333  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  36.53 
 
 		 504 aa  332  8e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  38.07 
 
 		 512 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  37.34 
 
 		 510 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  37.75 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  40.04 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  34.85 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  35.69 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  36.67 
 
 		 506 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  36.82 
 
 		 512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  36.63 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  37.57 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  37.75 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  36.79 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  37.36 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  37.04 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  35.07 
 
 		 528 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  35.25 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  36.3 
 
 		 506 aa  327  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  38.11 
 
 		 512 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  36.85 
 
 		 518 aa  326  6e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  36.13 
 
 		 497 aa  326  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  37.36 
 
 		 512 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  36.45 
 
 		 509 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  37.8 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  37.79 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  37.5 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>