79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4259 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  58.82 
 
 		 206 aa  234  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  65.64 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  64.1 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  62.2 
 
 		 164 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  58.85 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.31 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.31 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  31.89 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  31.89 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  34.07 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.69 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.44 
 
 		 264 aa  81.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.87 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  30.73 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.79 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.11 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.96 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.53 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.97 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  27.53 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.23 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.96 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.81 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.67 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.92 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.53 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.87 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  27.12 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.5 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  28.16 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 		 175 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  26.17 
 
 		 179 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  28.91 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  26.95 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.31 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.11 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.35 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.24 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  26.95 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.84 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  23.67 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  28.57 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  29.63 
 
 		 152 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>