22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3965 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3965  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 571 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 582 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 687 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 634 aa  55.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 641 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 479 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 606 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 611 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 456 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 468 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 455 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 545 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 117 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 572 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  22.3 
 
 		 556 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0666  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 110 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0430464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 433 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.49 
 
 		 548 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 619 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>