84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2272 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  206  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  61.29 
 
 
93 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  66.29 
 
 
97 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  61.29 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  61.29 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  57.14 
 
 
102 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  56.04 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  53.76 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  49.46 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  49.44 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  47.78 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  47.19 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  44.68 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  44.94 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  43.75 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  42.05 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  42.71 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  46.07 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  39.13 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  43.33 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  43.33 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  41.76 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  45.05 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  40.86 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  42.22 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  38.3 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  47.13 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  47.13 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  34.74 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  37.63 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  39.33 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2490  putative inner membrane protein  63.04 
 
 
47 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.288099  normal  0.980067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  41.94 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  41.76 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  37.63 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  42.05 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  41.94 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  42.22 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  44.3 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  41.76 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  40.45 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  38.89 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  38.89 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  38.37 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  39.56 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  40.86 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  40.86 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  39.78 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  40.23 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
92 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  42.11 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  38.71 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  42.53 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  42.53 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  39.13 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  34.04 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  34.44 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  36.73 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  30.77 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  38.04 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  32.22 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  32.26 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  34.38 
 
 
86 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  29.55 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  31.18 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  32.22 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  43.75 
 
 
78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  41.38 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  31.52 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  30.34 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  35.42 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  31.82 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  35.16 
 
 
102 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>