36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0331 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  70.91 
 
 		 110 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  52.73 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  57.3 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  49.49 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  45.21 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  32.65 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  30.39 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  29.36 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  32.67 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  32.89 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  33.78 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  32.18 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  29.73 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  27.72 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  30.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  34.48 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  32 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  26.73 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  29.87 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  28.41 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  24.78 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>