More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4370 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 
467 aa  911    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  65.38 
 
 
468 aa  569  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  66.45 
 
 
467 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  66.45 
 
 
467 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  64.58 
 
 
470 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  63.54 
 
 
467 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  64.36 
 
 
467 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  64.67 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  64.45 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  64.45 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  63.03 
 
 
471 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  62.61 
 
 
495 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  62.21 
 
 
471 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  62.92 
 
 
463 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.98 
 
 
464 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  59.84 
 
 
493 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.54 
 
 
481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  61.54 
 
 
460 aa  511  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  59.91 
 
 
479 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  62.09 
 
 
483 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.18 
 
 
467 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.08 
 
 
460 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  61.11 
 
 
465 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  63.54 
 
 
463 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  56.99 
 
 
471 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  57.85 
 
 
478 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  58.11 
 
 
471 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  58.55 
 
 
476 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  58.15 
 
 
463 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  58.76 
 
 
491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  55.74 
 
 
468 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.87 
 
 
480 aa  448  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  58.55 
 
 
495 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  52.64 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.91 
 
 
506 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  56.65 
 
 
478 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 
470 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 
471 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 
465 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
465 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
470 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
470 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
470 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
465 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
459 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
459 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.25 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 
492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 
491 aa  213  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
472 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
459 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.46 
 
 
470 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
459 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 
470 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 
474 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
459 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 
468 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 
459 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.2 
 
 
459 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.06 
 
 
469 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
459 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.69 
 
 
459 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
473 aa  206  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 
479 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  27.71 
 
 
473 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
467 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
562 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.83 
 
 
475 aa  203  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
464 aa  203  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 
470 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.46 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.61 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
616 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
585 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 
459 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
463 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.05 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
462 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
473 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>