More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1577 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  73.44 
 
 
197 aa  310  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  72.63 
 
 
207 aa  298  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  71.28 
 
 
195 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  71.28 
 
 
195 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  71.28 
 
 
195 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  71.13 
 
 
218 aa  292  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  74.05 
 
 
194 aa  291  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  67.37 
 
 
205 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  70.05 
 
 
200 aa  280  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  75.53 
 
 
229 aa  278  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  69.15 
 
 
197 aa  277  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  67.5 
 
 
213 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  66.5 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  67.37 
 
 
221 aa  270  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  66.5 
 
 
213 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  66 
 
 
213 aa  268  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  63.13 
 
 
207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  66.15 
 
 
206 aa  266  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  66.49 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  66.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  63.73 
 
 
214 aa  262  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.47 
 
 
238 aa  262  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  65.08 
 
 
217 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  66.67 
 
 
207 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  64.02 
 
 
213 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.13 
 
 
210 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  64.44 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  65.57 
 
 
192 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  68.97 
 
 
225 aa  250  9.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  70 
 
 
203 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  69.1 
 
 
195 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  63.16 
 
 
207 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  65.71 
 
 
236 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.54 
 
 
205 aa  244  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  62.3 
 
 
194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.41 
 
 
200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.09 
 
 
240 aa  244  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  61.86 
 
 
213 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.52 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  64.94 
 
 
206 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60 
 
 
208 aa  241  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  65 
 
 
219 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  61.2 
 
 
194 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  66.27 
 
 
210 aa  236  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  64.57 
 
 
204 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  61.58 
 
 
203 aa  235  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  56.32 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  60.2 
 
 
211 aa  231  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.88 
 
 
229 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.88 
 
 
229 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  59.65 
 
 
206 aa  228  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  61.36 
 
 
205 aa  224  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.72 
 
 
202 aa  223  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.32 
 
 
200 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.78 
 
 
232 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  57.23 
 
 
225 aa  222  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.27 
 
 
231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.47 
 
 
200 aa  221  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.79 
 
 
203 aa  221  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
214 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.57 
 
 
224 aa  221  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
214 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.79 
 
 
203 aa  221  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  61.99 
 
 
207 aa  221  8e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  61.05 
 
 
200 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3068  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.89 
 
 
207 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.201714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.61 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.63 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.14 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.47 
 
 
194 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1107  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.72 
 
 
206 aa  219  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.350822  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.88 
 
 
200 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1608  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.38 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191797  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  61.29 
 
 
205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3234  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.06 
 
 
207 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0374566  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  60.47 
 
 
218 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3054  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.06 
 
 
207 aa  218  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311725  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3092  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.06 
 
 
207 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.39 
 
 
207 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.63 
 
 
244 aa  218  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3264  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.89 
 
 
207 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.30385  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
222 aa  217  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60 
 
 
204 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.65 
 
 
228 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.8 
 
 
219 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4364  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  51.42 
 
 
236 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.375461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0405  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.8 
 
 
225 aa  216  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.85 
 
 
207 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.64318e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1095  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.37 
 
 
207 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000583712  hitchhiker  0.00000378515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1305  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.12 
 
 
197 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0473  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.85 
 
 
207 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131223  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.38 
 
 
200 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1102  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.65 
 
 
197 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0360  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.85 
 
 
207 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.93543e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0100  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.56 
 
 
202 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.85 
 
 
207 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.86752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1048  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.37 
 
 
207 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000032499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.85 
 
 
207 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00392  hypothetical protein  52.85 
 
 
207 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.12461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>