64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1145 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  65.27 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  55.42 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  54.88 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  52.73 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  52.73 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  53.33 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  55 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  52.73 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  53.01 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  52.44 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  53.66 
 
 		 170 aa  170  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  52.44 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  51.83 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  51.83 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  51.5 
 
 		 169 aa  163  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  52.47 
 
 		 168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  50.61 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  51.22 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  41.36 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  44.38 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  33.65 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.96 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  37.84 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  28.83 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.29 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  33.02 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  32.22 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  23.85 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  25.62 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  26.28 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  28.87 
 
 		 202 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  27.52 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  28.18 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  33.78 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  36 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.55 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  26.92 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  37.97 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.9 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  29 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  29.35 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  29.35 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  26.42 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.91 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.11 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  28.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.08 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  32.76 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  25.93 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  29.7 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  28.7 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  25.93 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  25.93 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  26.32 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  28.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  28.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  28.92 
 
 		 184 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  26.79 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  30.97 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.1 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  27 
 
 		 186 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>