More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1724 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  68.85 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  62.79 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  63.49 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  59.2 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  58.4 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 161 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 213 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  37.86 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0453  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4192  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.91 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  33.04 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  30.97 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3780  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  30.97 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3058  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  36.9 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  35.92 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  30 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  29.31 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  30.36 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 247 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  30.48 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  34.34 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  47.95 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  30.28 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  29.31 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  30.28 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  33.02 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  32.08 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>