241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1655 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  100 
 
 		 134 aa  279  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  80.6 
 
 		 134 aa  233  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  71.76 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  58.96 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  62.31 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  57.14 
 
 		 134 aa  167  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  55.04 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  53.85 
 
 		 133 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  44.35 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  40.68 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  35.83 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  36.75 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  38.94 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  35 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06185  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 		 493 aa  82  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0429141 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  32.45 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  39.36 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  33.59 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  32 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  30.43 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  32.77 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  36.36 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  29.01 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0846  CoA-binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  28.8 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  30.95 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 707 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0916  CoA-binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.7124  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  25.86 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  30 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  27.43 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  25.2 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 669 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  24.41 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  30.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  28.24 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  29.46 
 
 		 680 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  28.24 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  29.92 
 
 		 700 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.59 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  27.78 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  34.04 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  30.08 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  28.32 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.48 
 
 		 660 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 893 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 705 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.85 
 
 		 697 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.57 
 
 		 699 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  28.32 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  30 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  27.97 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  30.59 
 
 		 707 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  26.61 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  30.15 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  30.17 
 
 		 612 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  28.81 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  34.88 
 
 		 688 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 		 887 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 712 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 660 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.43 
 
 		 697 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 508 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28 
 
 		 698 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  26.88 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  28.7 
 
 		 696 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 		 727 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 703 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 711 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  25 
 
 		 715 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  27.83 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  24.14 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  22.9 
 
 		 895 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  29.06 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  25.6 
 
 		 701 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 689 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>