95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1571 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  85.92 
 
 		 74 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  81.08 
 
 		 74 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  81.08 
 
 		 74 aa  124  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  52.11 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  52.86 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  50.72 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  45.71 
 
 		 796 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  45.83 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  41.43 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  43.75 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  41.43 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  40.85 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  43.75 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  41.18 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  41.18 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  50.91 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  39.19 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  37.33 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  37.84 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  37.84 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  39.71 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  32.39 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  36.99 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  39.66 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  43.4 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  50.98 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  38.36 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  35.62 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  42.19 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.88 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  38.36 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  37.68 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  38.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  40 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  36.11 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  40.38 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  42.59 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  35.62 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  43.64 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  32.88 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  43.64 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  36.99 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  36.99 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  36.99 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  36.99 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  33.9 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  33.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  29.58 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  30.3 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  37.74 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.09 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  32.86 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  42.31 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  43.86 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  30.99 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  34.29 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.09 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  31.43 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  33.9 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  40.38 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  33.9 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  29.17 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  34.25 
 
 		 196 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.96 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  29.73 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  28.99 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  45.65 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  28.99 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  31.88 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  46.15 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  36.54 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  33.93 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  32.84 
 
 		 72 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  29.85 
 
 		 79 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  31.67 
 
 		 81 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>