184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3274 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  44.01 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  42.53 
 
 
306 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  43.56 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  35.33 
 
 
298 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
298 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  31.33 
 
 
294 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  28.99 
 
 
302 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  28.52 
 
 
296 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  30.13 
 
 
310 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.56 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  27.85 
 
 
292 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  26.54 
 
 
301 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  28.06 
 
 
297 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.59 
 
 
297 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  27.39 
 
 
298 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  26.79 
 
 
315 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
295 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
301 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
298 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  26.33 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  24.51 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  24.36 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  25.81 
 
 
303 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  26.64 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  27.45 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  25.32 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  22.39 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.21 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  26.5 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.28 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  25.16 
 
 
299 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  22.77 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  23.33 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  22.5 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  22.37 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  26.04 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  25.95 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.46 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  32.19 
 
 
523 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  29.36 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  21.65 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  23.84 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  30.72 
 
 
507 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  23.28 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.16 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  24.52 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  28.47 
 
 
594 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.16 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  23.3 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  22.53 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  22.53 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  25.88 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25.87 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  23.81 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  23.81 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  23.25 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  23.25 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  21.29 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  23.25 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  23.25 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  23.25 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1620  flagellar hook-associated protein 3  29.76 
 
 
497 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.82 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  24.22 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  27.51 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  23.78 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  23.23 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  27.33 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  30.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
530 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  21.67 
 
 
870 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  30.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  23.64 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  26.54 
 
 
438 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.48 
 
 
410 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  24 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  30.46 
 
 
514 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  23.6 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.21 
 
 
400 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  24.92 
 
 
316 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  23.1 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  23.62 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.26 
 
 
404 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  23.34 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 
562 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  24.46 
 
 
400 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  22.5 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  25.46 
 
 
408 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  30.15 
 
 
512 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  25.16 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  25.16 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>