More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0354 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  100 
 
 
103 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  51.46 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.41 
 
 
711 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  41.41 
 
 
711 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  36.36 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.24 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37.89 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.86 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 
470 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 
480 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.99 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.1 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  34.88 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
480 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.93 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.89 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
269 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
460 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.63 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.74 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.68 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  34.29 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
216 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.17 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
192 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  41.79 
 
 
130 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 
221 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  30.1 
 
 
221 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  30.53 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 
221 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  37.63 
 
 
177 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  35.56 
 
 
479 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.17 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  40 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
222 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  30.69 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
284 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  34.07 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.61 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
282 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  33.72 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>