163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3074 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3074  CheW protein  100 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.442292  hitchhiker  0.00529437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5449  CheW protein  37.5 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.470199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2953  CheW protein  35.98 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0240  CheW protein  38.55 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00382894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3061  CheW protein  34.16 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2835  CheW domain-containing protein  34.16 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  36.42 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  44.29 
 
 		 779 aa  54.3  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.64 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  32.99 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  27.03 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  32.99 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.96 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  47.89 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  29.75 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  29.37 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.33 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.33 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  26 
 
 		 444 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  32.69 
 
 		 531 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  30.94 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  32.47 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  28.3 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  27.66 
 
 		 308 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  31.94 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  27.66 
 
 		 308 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  24.69 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  28.21 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  50.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  25.58 
 
 		 528 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  50.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  34.02 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  34.02 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  31.58 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.38 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.67 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.17 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  23.31 
 
 		 313 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  30.93 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  27.61 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  26.21 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  31.4 
 
 		 333 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  28.66 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  26.09 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  28.12 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  26.09 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  32.47 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  31.4 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  31.4 
 
 		 333 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  24.83 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  34.04 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.49 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  24.82 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  40.21 
 
 		 568 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  31.4 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  34.29 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  50.85 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  25 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  26.87 
 
 		 321 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  31.4 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  31.82 
 
 		 907 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  24.29 
 
 		 317 aa  46.2  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  25.16 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  25.41 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  32.99 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  26.06 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  34.51 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  24.11 
 
 		 317 aa  45.1  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.59 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  20 
 
 		 478 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.68 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  30.32 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  33.82 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  27.59 
 
 		 298 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  27.59 
 
 		 298 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  27.59 
 
 		 298 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  31.47 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  27.59 
 
 		 298 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.67 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  25.68 
 
 		 331 aa  44.3  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.37 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  25.18 
 
 		 136 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  27.91 
 
 		 330 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  29.5 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  26.28 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  34.92 
 
 		 533 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  30.77 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  24.66 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  27.73 
 
 		 325 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  32 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.92 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  28.42 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  30.95 
 
 		 479 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  47.54 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>