60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4657 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  100 
 
 		 320 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  49.53 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  38.54 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  39.16 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  38.49 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  30.97 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  33.94 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  34.33 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  34.08 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  30.23 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  29.18 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  29.76 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  25.61 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  29.68 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.83 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  26.23 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  28.67 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  25.85 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.12 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  25.65 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  32.21 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  38.98 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  25 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  24.34 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 376 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  28.18 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  28.81 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  28.07 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  27.93 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.81 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  35.44 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  27.93 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  34.18 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.48 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  27.92 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  31.3 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  29.41 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  31.25 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  32.3 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.71 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  33.09 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  33.59 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.2 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.09 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  29.73 
 
 		 1033 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>