More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3149 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 164 aa  319  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  64.44 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  65.91 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  67.44 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  66.28 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  66.28 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  66.28 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  66.28 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  60.44 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  62.79 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  65.43 
 
 		 84 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 115 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.21 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  33.73 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.56 
 
 		 115 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 113 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.1 
 
 		 119 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.56 
 
 		 115 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.68 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 96 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.1 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.54 
 
 		 107 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  49.28 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>