More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2795 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  75.85 
 
 		 265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  72.2 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  73.86 
 
 		 277 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  70.34 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  73.76 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  65.38 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  61.65 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  60.84 
 
 		 285 aa  304  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  43.87 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  44.49 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  47.31 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  45.38 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.62 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 277 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  42.36 
 
 		 267 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  40.95 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  40.52 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  40.95 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  40.52 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.66 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.66 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.66 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  39.66 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  39.66 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  38.27 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  42.79 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  40.79 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  36.63 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  44.98 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.64 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  39.52 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  39.52 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  38.42 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  40.34 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  40.35 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  36.94 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.59 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  39.6 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 		 436 aa  142  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.26 
 
 		 490 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.85 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 		 497 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.17 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  41.49 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.34 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.5 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  38.75 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  38.11 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  34.15 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  36.8 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 		 484 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  36.14 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  34.16 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  32.22 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.9 
 
 		 492 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  38.6 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  36.17 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  36.22 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>