More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3445 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  567  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  36.84 
 
 
238 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.83 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.09 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  34.45 
 
 
208 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.25 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.86 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.4 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
487 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  27.59 
 
 
783 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.67 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.22 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.58 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.13 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25.94 
 
 
306 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
237 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
317 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.98 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.12 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.98 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.14 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.57 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.57 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.01 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.57 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.48 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.57 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.02 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.27 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.32 
 
 
336 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.58 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
230 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  25.42 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.01 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.41 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.08 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.74 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
196 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.52 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
293 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.38 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
417 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 
232 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.95 
 
 
258 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 
232 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.08 
 
 
235 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 
232 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.66 
 
 
245 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 
238 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
235 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.84 
 
 
239 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
540 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  23.87 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 
237 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>