More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2899 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  100 
 
 		 81 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  77.03 
 
 		 77 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  54.93 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  50.77 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  49.28 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  50.77 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  45.33 
 
 		 391 aa  77.4  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  49.23 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  45.83 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  43.66 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  39.19 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  40 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  41.18 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  45.83 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  46.27 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  42.11 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  46.27 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  43.48 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  44.87 
 
 		 402 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  43.08 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40.3 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  41.79 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  40.79 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  38.89 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  45.71 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  46.27 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  41.18 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  38.81 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  41.18 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  40.3 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  40.3 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  44.78 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  45.71 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  45.71 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  41.54 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  44.29 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  44.12 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  44.93 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  46.27 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  44.12 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  42.65 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  36.49 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  36.49 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  34.57 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  38.81 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  41.03 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  38.81 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  36.9 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  41.18 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  38.81 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  44.12 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  40.3 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  36.05 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  38.67 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  36.76 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  41.03 
 
 		 86 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  34.21 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  34.92 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.82 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  40.58 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>