More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0508 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  72.9 
 
 
430 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  89.02 
 
 
430 aa  813    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  73.36 
 
 
430 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  72.9 
 
 
430 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
431 aa  890    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  66.36 
 
 
431 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 
440 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 
435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
440 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
432 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 
429 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
447 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 
440 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
434 aa  553  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
432 aa  545  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 
442 aa  544  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 
431 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 
432 aa  529  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 
433 aa  531  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 
431 aa  531  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
441 aa  528  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
434 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
448 aa  518  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
449 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 
447 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 
448 aa  511  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 
435 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 
430 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 
434 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 
434 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 
434 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
430 aa  409  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
432 aa  385  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
431 aa  374  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
431 aa  372  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
430 aa  366  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
431 aa  368  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
431 aa  360  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
501 aa  359  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
479 aa  302  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
464 aa  300  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
466 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
473 aa  293  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
479 aa  292  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
467 aa  291  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
460 aa  290  4e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
466 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
464 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
465 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
462 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  37 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
462 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
477 aa  281  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
460 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
465 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
466 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
481 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
464 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
454 aa  280  4e-74  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
472 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
466 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
472 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
466 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
463 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
466 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
466 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
466 aa  279  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
466 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
463 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
463 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
466 aa  279  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
464 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>