81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2553 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0896  hypothetical protein  67.97 
 
 		 153 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0891  type II secretory pathway pseudopilin PulG  36.36 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.21 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  41.27 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1015  hypothetical protein  25.18 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  41.82 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  41.82 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.77 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  29.58 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  29.6 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  33.82 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0718  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 		 137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 146 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 		 137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0727  general secretion pathway protein G  30.17 
 
 		 137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.807557  normal  0.202757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  52.5 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0717  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 		 137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  52.5 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.55 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  52.63 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  38.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  38.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  38.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  38.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  31.15 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  27.91 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.74 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  43.4 
 
 		 123 aa  40.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>