More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1539 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  73.33 
 
 		 270 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  67.41 
 
 		 270 aa  380  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2692  exonuclease III  65.06 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31650  exonuclease III  63.94 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  64.68 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  64.68 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  64.68 
 
 		 270 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  64.31 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  63.94 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  63.2 
 
 		 270 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  63.57 
 
 		 270 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  63.57 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2379  exonuclease III  63.1 
 
 		 276 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88562e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  62.83 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  60.52 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1995  exonuclease III  58.82 
 
 		 272 aa  346  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2052  exonuclease III  60.74 
 
 		 273 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  61.25 
 
 		 268 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  61.25 
 
 		 268 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  61.25 
 
 		 268 aa  341  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2366  exodeoxyribonuclease III  58.67 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1695  exonuclease III  61.57 
 
 		 268 aa  338  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1873  exonuclease III  60.15 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2206  exodeoxyribonuclease III  61.19 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  60.52 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1413  exonuclease III  60.15 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  60.82 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1429  exonuclease III  60.15 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2044  exonuclease III  60.15 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1396  exonuclease III  60.15 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0639091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  61.94 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1441  exonuclease III  60.3 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2468  exonuclease III  60.3 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.906333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1893  exodeoxyribonuclease III  60.53 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0788201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1883  exonuclease III  60.53 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01718  exonuclease III  60.53 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01706  hypothetical protein  60.53 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1972  exonuclease III  60.53 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1997  exonuclease III  60.53 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.892579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1833  exonuclease III  60.53 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  57.14 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  58.27 
 
 		 270 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  60.82 
 
 		 272 aa  329  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  57.14 
 
 		 270 aa  327  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  57.89 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  57.52 
 
 		 270 aa  326  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  57.52 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000598983  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  56.55 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  56.02 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  54.48 
 
 		 269 aa  323  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  55.64 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2648  exodeoxyribonuclease III  55.22 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  57.84 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  56.77 
 
 		 268 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  56.77 
 
 		 270 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000137718  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  57.14 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  54.89 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  56.77 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000050651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  56.77 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000224276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  56.77 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000202985  hitchhiker  0.0000000000656111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1319  exodeoxyribonuclease III  55.97 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  56.02 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2139  exodeoxyribonuclease III  61.11 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  54.51 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1465  exonuclease III  54.98 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00148193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1192  exonuclease III  56.67 
 
 		 274 aa  314  8e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166558  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1258  exonuclease III  57.14 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000275406  normal  0.0123433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1199  exonuclease III  57.04 
 
 		 274 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.712214  normal  0.0221694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  53.76 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  43.91 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  42.75 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  38.01 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  37.64 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.64 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  41.64 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  40.88 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  40.67 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  41.33 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  40.51 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  40.07 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  39.42 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  37.87 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.52 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  39.03 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  36.16 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  38.89 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.74 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  40.51 
 
 		 269 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  39.19 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  35.79 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>