123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0885 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  100 
 
 		 364 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  81.82 
 
 		 369 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  67.77 
 
 		 363 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  64.74 
 
 		 363 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  61.98 
 
 		 363 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  58.4 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  58.68 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  58.68 
 
 		 363 aa  434  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.85 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  59.62 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.1 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.74 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.19 
 
 		 370 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.5 
 
 		 364 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.5 
 
 		 364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.14 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  51.1 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  30.1 
 
 		 495 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  32.02 
 
 		 476 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  22.97 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  25.68 
 
 		 697 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  23.82 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  28.21 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.73 
 
 		 698 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  24.73 
 
 		 699 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  22.19 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  21.97 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  22.5 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  21.45 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  21.43 
 
 		 707 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  23.88 
 
 		 719 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  21.14 
 
 		 707 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  22.9 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.51 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  20.22 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  22.67 
 
 		 700 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.3 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  24.19 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  22.32 
 
 		 702 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  23.24 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  28.87 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  23.1 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  25.69 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  24.27 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  20.64 
 
 		 704 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  24.35 
 
 		 704 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  25.33 
 
 		 691 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  24.08 
 
 		 704 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  22.46 
 
 		 703 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  19.84 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  23.81 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  20.3 
 
 		 712 aa  57  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  23.59 
 
 		 697 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  23.18 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  19.62 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  23.42 
 
 		 696 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.54 
 
 		 695 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  22.87 
 
 		 695 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  26.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  19.33 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  27.54 
 
 		 239 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  22.87 
 
 		 699 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  28.64 
 
 		 264 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  21.17 
 
 		 702 aa  53.9  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  31.45 
 
 		 241 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  30.43 
 
 		 243 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  22.63 
 
 		 702 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  22.4 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  23.28 
 
 		 695 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  21.47 
 
 		 691 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  22.87 
 
 		 696 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3692  phosphate acetyltransferase  23.1 
 
 		 691 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  18.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  22.54 
 
 		 685 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  20.89 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  26.19 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  24.34 
 
 		 703 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3048  phosphate acetyltransferase  22.05 
 
 		 701 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0392547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  27.09 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  25.79 
 
 		 228 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  26.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  28.45 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  23.14 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6197  phosphate acetyltransferase  22.22 
 
 		 714 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  26.7 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  26.32 
 
 		 718 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  29.05 
 
 		 212 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2093  Phosphate acetyltransferase  24.07 
 
 		 679 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.406521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  21.69 
 
 		 689 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  25.25 
 
 		 226 aa  46.2  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  27.85 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  19.3 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  25 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45576  predicted protein  25.38 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3177  phosphate acetyltransferase  21.21 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0503122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  20.45 
 
 		 683 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  22.54 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  22.32 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002967  phosphate acetyltransferase  19.95 
 
 		 714 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.596051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  27.04 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>