More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0795 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  51.46 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  36 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  35 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  40 
 
 
480 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.46 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.37 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
269 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  40.7 
 
 
480 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.35 
 
 
346 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.02 
 
 
201 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
161 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.29 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  32.32 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 
361 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  34.58 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  31 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 
459 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
470 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
198 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
197 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  36.47 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.53 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
461 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  32 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  34.34 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.53 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  31.31 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  32.65 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  35 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  34.83 
 
 
711 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.72 
 
 
216 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.68 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  31.87 
 
 
201 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
225 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
225 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  33.33 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.78 
 
 
389 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.05 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.99 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>